Sprawdziłeś na innym monitorze/TV? Atari nie produkuje "katalogowego" S-Video, poziomy sygnałów nie są zgodne z normą. Bo norma powstała później (niż 800, gdzie Chroma+Luma pojawiły się najpierw). Możliwe, że twój TV głupieje i nie wyświetla koloru jak należy.
tu masz dla Atari XE rozpiskę gdzie są sygnały. Na wyłączonym komputerze sprawdź (jeśli posiadasz multimetr) rezystancję między tymi punktami a masą (może być ground plane czyli metalowa część wokół płyty). Optymalnie powinno być 75R.
Mam 65xe i 130xe, oba zachowują się identycznie z tym kablem. Sprawdzę jeszcze jaki obraz daje c64c z kablem od tego samego elektronika i jak będzie to samo to mu po prostu kable odeślę, żeby zmienił oporniki czy inny żużel.
Może być problem z kablem we wtyczce. Może być z generowaniem sygnału s-video z komputera i z odbieraniem sygnału s-video przez TV. Tak jak Łukasz napisał, sprawdź inny TV jeszcze.
Trzeba używać composite video albo modulatora, nie będzie problemów z efektami, duchami i diabeł wie czym jeszcze a i atarynka będzie cała, a nie okaleczona i nie do odtworzenia do stanu fabrycznego. No i do każdego telewizora się podłączy, nie trzeba będzie kupować dodatkowego odbiornika z s-video.